Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDE4AP27815 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
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