Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNTFRP26992 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms