Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms