Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA1P21709 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms