Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT1P21579 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT1P21579 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT1P21579 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT1P21579 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT1P21579 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms