Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms