Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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