Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN1P17029 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN1P17029 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN1P17029 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN1P17029 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN1P17029 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN1P17029 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN1P17029 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN1P17029 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN1P17029 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN1P17029 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN1P17029 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN1P17029 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN1P17029 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN1P17029 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZKSCAN1P17029 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZKSCAN1P17029 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
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