Protein–RNA interactions for Protein: P15514

AREG, Amphiregulin, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AREGP15514 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AREGP15514 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AREGP15514 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AREGP15514 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AREGP15514 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AREGP15514 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AREGP15514 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AREGP15514 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AREGP15514 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AREGP15514 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AREGP15514 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AREGP15514 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AREGP15514 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AREGP15514 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AREGP15514 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AREGP15514 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AREGP15514 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AREGP15514 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AREGP15514 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AREGP15514 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AREGP15514 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AREGP15514 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AREGP15514 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AREGP15514 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AREGP15514 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AREGP15514 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms