Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT10P13645 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
KRT10P13645 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT10P13645 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT10P13645 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT10P13645 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT10P13645 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT10P13645 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT10P13645 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT10P13645 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT10P13645 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT10P13645 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT10P13645 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT10P13645 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT10P13645 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT10P13645 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT10P13645 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT10P13645 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT10P13645 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT10P13645 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT10P13645 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms