Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG2P13521 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG2P13521 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG2P13521 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG2P13521 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG2P13521 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG2P13521 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG2P13521 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG2P13521 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG2P13521 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG2P13521 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG2P13521 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG2P13521 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG2P13521 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG2P13521 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG2P13521 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG2P13521 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms