Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A1P11836 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms