Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOP2AP11388 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms