Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms