Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD2P0DJD1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RGPD2P0DJD1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms