Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB7P09629 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms