Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSLP07711 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSLP07711 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSLP07711 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSLP07711 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSLP07711 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSLP07711 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSLP07711 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSLP07711 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSLP07711 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSLP07711 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSLP07711 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSLP07711 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSLP07711 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSLP07711 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSLP07711 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSLP07711 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSLP07711 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSLP07711 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSLP07711 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSLP07711 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSLP07711 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSLP07711 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSLP07711 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSLP07711 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSLP07711 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSLP07711 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSLP07711 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSLP07711 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSLP07711 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSLP07711 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSLP07711 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSLP07711 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSLP07711 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSLP07711 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSLP07711 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSLP07711 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSLP07711 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSLP07711 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSLP07711 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSLP07711 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSLP07711 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSLP07711 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSLP07711 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSLP07711 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSLP07711 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSLP07711 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSLP07711 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSLP07711 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSLP07711 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSLP07711 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSLP07711 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSLP07711 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSLP07711 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSLP07711 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSLP07711 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSLP07711 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSLP07711 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSLP07711 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSLP07711 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSLP07711 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSLP07711 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms