Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms