Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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ZBED1O96006 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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ZBED1O96006 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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