Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms