Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms