Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5LO95447 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LCA5LO95447 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LCA5LO95447 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LCA5LO95447 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LCA5LO95447 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LCA5LO95447 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LCA5LO95447 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5LO95447 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5LO95447 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5LO95447 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5LO95447 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LCA5LO95447 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5LO95447 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5LO95447 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5LO95447 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5LO95447 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5LO95447 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5LO95447 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5LO95447 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5LO95447 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5LO95447 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5LO95447 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5LO95447 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5LO95447 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5LO95447 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5LO95447 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5LO95447 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5LO95447 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5LO95447 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5LO95447 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5LO95447 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LCA5LO95447 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LCA5LO95447 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5LO95447 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5LO95447 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5LO95447 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5LO95447 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5LO95447 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms