Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC2O95347 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC2O95347 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC2O95347 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC2O95347 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC2O95347 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC2O95347 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC2O95347 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC2O95347 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC2O95347 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC2O95347 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC2O95347 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC2O95347 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC2O95347 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC2O95347 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC2O95347 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC2O95347 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC2O95347 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC2O95347 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC2O95347 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC2O95347 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC2O95347 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC2O95347 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC2O95347 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC2O95347 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC2O95347 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC2O95347 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC2O95347 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC2O95347 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC2O95347 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC2O95347 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC2O95347 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC2O95347 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC2O95347 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC2O95347 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC2O95347 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC2O95347 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC2O95347 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC2O95347 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC2O95347 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC2O95347 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC2O95347 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC2O95347 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC2O95347 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC2O95347 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC2O95347 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC2O95347 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC2O95347 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC2O95347 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC2O95347 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC2O95347 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC2O95347 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC2O95347 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC2O95347 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC2O95347 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC2O95347 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC2O95347 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms