Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms