Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG12O94817 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG12O94817 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG12O94817 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG12O94817 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG12O94817 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG12O94817 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG12O94817 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG12O94817 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG12O94817 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG12O94817 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG12O94817 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG12O94817 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG12O94817 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG12O94817 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG12O94817 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG12O94817 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG12O94817 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG12O94817 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG12O94817 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG12O94817 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG12O94817 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG12O94817 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG12O94817 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG12O94817 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG12O94817 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG12O94817 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG12O94817 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG12O94817 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG12O94817 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms