Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms