Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG13O75143 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG13O75143 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG13O75143 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG13O75143 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG13O75143 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG13O75143 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG13O75143 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG13O75143 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG13O75143 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG13O75143 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG13O75143 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG13O75143 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG13O75143 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG13O75143 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG13O75143 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG13O75143 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG13O75143 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG13O75143 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG13O75143 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG13O75143 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG13O75143 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG13O75143 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG13O75143 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG13O75143 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG13O75143 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG13O75143 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG13O75143 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG13O75143 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG13O75143 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG13O75143 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG13O75143 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG13O75143 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG13O75143 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG13O75143 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG13O75143 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG13O75143 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG13O75143 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG13O75143 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATG13O75143 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATG13O75143 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
ATG13O75143 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG13O75143 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms