Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOL3O60936 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOL3O60936 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOL3O60936 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOL3O60936 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOL3O60936 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOL3O60936 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOL3O60936 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOL3O60936 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOL3O60936 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOL3O60936 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOL3O60936 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOL3O60936 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOL3O60936 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOL3O60936 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOL3O60936 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOL3O60936 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOL3O60936 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NOL3O60936 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOL3O60936 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOL3O60936 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOL3O60936 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOL3O60936 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOL3O60936 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOL3O60936 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOL3O60936 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOL3O60936 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOL3O60936 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOL3O60936 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOL3O60936 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOL3O60936 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOL3O60936 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOL3O60936 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOL3O60936 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms