Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOFO60613 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms