Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms