Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEMFO60524 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEMFO60524 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEMFO60524 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEMFO60524 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEMFO60524 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEMFO60524 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEMFO60524 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEMFO60524 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEMFO60524 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEMFO60524 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEMFO60524 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEMFO60524 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NEMFO60524 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEMFO60524 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms