Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms