Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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