Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERI3O43414 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERI3O43414 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERI3O43414 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERI3O43414 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERI3O43414 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERI3O43414 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERI3O43414 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERI3O43414 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERI3O43414 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERI3O43414 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERI3O43414 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERI3O43414 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERI3O43414 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERI3O43414 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERI3O43414 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERI3O43414 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERI3O43414 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERI3O43414 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERI3O43414 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERI3O43414 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERI3O43414 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERI3O43414 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERI3O43414 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERI3O43414 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERI3O43414 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERI3O43414 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERI3O43414 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERI3O43414 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERI3O43414 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERI3O43414 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERI3O43414 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERI3O43414 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms