Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRXO43186 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRXO43186 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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