Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms