Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APAF1O14727 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APAF1O14727 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APAF1O14727 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APAF1O14727 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APAF1O14727 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APAF1O14727 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APAF1O14727 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APAF1O14727 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
APAF1O14727 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APAF1O14727 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APAF1O14727 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
APAF1O14727 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APAF1O14727 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APAF1O14727 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APAF1O14727 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APAF1O14727 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APAF1O14727 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APAF1O14727 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APAF1O14727 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APAF1O14727 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APAF1O14727 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APAF1O14727 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APAF1O14727 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APAF1O14727 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APAF1O14727 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APAF1O14727 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APAF1O14727 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APAF1O14727 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APAF1O14727 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APAF1O14727 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APAF1O14727 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APAF1O14727 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
APAF1O14727 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APAF1O14727 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APAF1O14727 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APAF1O14727 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APAF1O14727 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APAF1O14727 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
APAF1O14727 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APAF1O14727 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APAF1O14727 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APAF1O14727 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms