Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
J3KT08 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
J3KT08 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
J3KT08 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
J3KT08 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
J3KT08 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
J3KT08 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
J3KT08 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
J3KT08 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
J3KT08 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
J3KT08 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
J3KT08 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
J3KT08 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
J3KT08 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
J3KT08 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
J3KT08 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
J3KT08 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
J3KT08 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
J3KT08 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3KT08 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms