Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GOLGA8SH3BPF8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms