Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms