Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4E171 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B4E171 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B4E171 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
B4E171 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
B4E171 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
B4E171 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
B4E171 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
B4E171 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B4E171 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B4E171 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B4E171 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
B4E171 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
B4E171 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B4E171 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4E171 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4E171 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4E171 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4E171 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4E171 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4E171 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4E171 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4E171 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4E171 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4E171 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4E171 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4E171 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4E171 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4E171 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4E171 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4E171 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4E171 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4E171 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms