Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DXG7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DXG7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DXG7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DXG7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DXG7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DXG7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DXG7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DXG7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DXG7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DXG7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DXG7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DXG7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DXG7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DXG7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DXG7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DXG7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DXG7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DXG7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DXG7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DXG7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DXG7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DXG7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DXG7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DXG7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DXG7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DXG7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DXG7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DXG7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DXG7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DXG7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DXG7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DXG7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DXG7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DXG7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms