Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms