Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms