Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM200CA6NKL6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms