Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00862A6NCI5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms