Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCHNA4D1U4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms