Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC66A2RUB6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms