Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PUDPP1-201ENST00000421058 495 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AP001116.1-201ENST00000421604 762 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RPS28P8-201ENST00000435020 208 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC00444-201ENST00000435617 215 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL513318.1-201ENST00000437925 991 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 TUBB8P1-201ENST00000447235 727 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC012501.1-201ENST00000454312 555 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL133232.1-201ENST00000458293 483 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC117395.3-201ENST00000471176 680 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC079795.1-201ENST00000508847 358 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL645924.2-201ENST00000508865 900 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC104123.1-202ENST00000511775 581 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC022695.2-201ENST00000518042 768 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC091987.1-202ENST00000522464 789 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AP005597.3-201ENST00000532369 799 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC069234.3-201ENST00000544939 569 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC009121.2-201ENST00000572913 714 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ZNF559-205ENST00000586255 1016 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC015802.4-201ENST00000589963 578 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL158151.4-201ENST00000600965 507 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 BNIP3P17-201ENST00000605448 595 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL512413.1-201ENST00000606489 382 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC127070.5-201ENST00000623177 2104 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC01620-205ENST00000637248 546 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 PPARG-201ENST00000287820 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 GJB7-203ENST00000525899 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 GLYAT-202ENST00000344743 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MEF2A-203ENST00000449277 5182 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ADGRF2-201ENST00000296862 2127 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 GART-201ENST00000361093 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC01103-201ENST00000430551 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 IL24-202ENST00000367093 1819 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RAB3IP-215ENST00000551641 2840 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CEACAMP3-201ENST00000473762 1548 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 HNRNPA1-204ENST00000547276 1539 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 GPR63-201ENST00000229955 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LGSN-201ENST00000370657 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 NANOG-201ENST00000229307 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 IL26-201ENST00000229134 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RAET1K-201ENST00000403651 784 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 TIMD4-202ENST00000406964 581 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MIR1272-201ENST00000408106 129 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC006455.4-201ENST00000418297 528 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC111200.2-201ENST00000418877 505 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC007422.2-201ENST00000419809 167 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC006457.1-201ENST00000420733 392 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MTND1P10-201ENST00000426108 832 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 SEPHS1P1-201ENST00000426891 958 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RPL3P8-201ENST00000432928 1191 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ASS1P5-201ENST00000435496 1239 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ACTBP12-201ENST00000435871 418 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC01185-201ENST00000439412 554 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC073188.4-201ENST00000450077 528 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL353615.1-201ENST00000450850 390 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL109809.3-201ENST00000456875 246 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC123768.1-202ENST00000460684 461 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC100843.1-201ENST00000475372 550 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 GSTO3P-201ENST00000504733 718 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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