Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 MPEG1-201ENST00000361050 4442 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 ZFP42-203ENST00000618147 2338 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 PPIH-201ENST00000304979 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 TAC1-203ENST00000350485 975 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 GSTM1-203ENST00000369819 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 LST1-211ENST00000376110 433 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 SSX9-201ENST00000376909 591 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 TMEM213-201ENST00000397602 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC016877.1-201ENST00000420417 464 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 HSD3BP5-201ENST00000434856 1132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AL592182.2-201ENST00000442477 858 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AL136452.1-201ENST00000448495 439 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 STX18-IT1-201ENST00000515487 542 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 STH-201ENST00000537309 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC005230.1-201ENST00000555418 285 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 CCDC32-203ENST00000558113 576 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 CCDC32-210ENST00000559911 677 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 CCDC32-212ENST00000560305 557 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 C16orf45-203ENST00000561692 534 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC092142.1-202ENST00000567021 829 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC103808.6-201ENST00000578035 464 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC012301.1-201ENST00000586391 581 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC008770.1-206ENST00000589551 523 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC010680.5-201ENST00000605021 463 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC007388.1-201ENST00000426083 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 ZNF430-203ENST00000595401 3021 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 SLC16A1P1-201ENST00000486743 1510 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 OR2H2-202ENST00000641840 3061 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 RBBP4-206ENST00000458695 1674 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 PARP9-202ENST00000462315 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 CPM-202ENST00000546373 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC105383.1-202ENST00000505289 2820 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 CPB2-AS1-204ENST00000606991 3218 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 MMP20-201ENST00000260228 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 LAX1-202ENST00000367217 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 PHF6-203ENST00000370800 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 TRBV6-1-201ENST00000390353 401 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 YWHAZP3-201ENST00000415292 738 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 RBMY2GP-201ENST00000418671 1034 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 RBMY2FP-202ENST00000420346 1263 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC093580.1-201ENST00000420549 671 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AL355516.1-201ENST00000422082 746 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC034228.1-201ENST00000424244 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 PAICSP1-201ENST00000425324 1217 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AP000705.2-201ENST00000433524 1386 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms